Trop cool, Scooby-Doo !

Véra doit passer un entretien afin d'intégrer l'université Elias Kingston, la plus prestigieuse du monde. Cependant, la bande d'amis découvre que le fondateur de l'établissement revient sous forme de fantôme et terrorise les étudiants.

Chuck, un intrépide aventurier, demande de l'aide à Fred après s'être fait attaquer et capturer par un garde Zatari alors qu'il explorait des cavernes. En se lançant à sa poursuite, Scooby et ses amis tombent sur Rick, le dernier descendant Zatari qui leur livre quelques informations. Eux aussi sont pris en chasse par le guerrier et ils parviennent tout juste à lui échapper.

Scooby et ses amis montent à bord d'un paquebot appartenant au capitaine Mc Doon, le cousin Scott de Fred. Patron d'une compagnie de croisières offrant une exclusivité dans le secteur de Bribery Bay, un spot de plongée très recherché, Scott voit son business menacé par des monstres aquatiques qui s'en prennent aux plongeurs. La bande enquête.

Alors qu'il tourne une série TV bas de gamme dans un vieil immeuble gothique empli de gargouilles, le tournage et la carrière de Daniel Valentino sont fortement compromis suite à l'attaque d'une gargouille qui semble avoir pris vie. Toute son équipe de techniciens démissionne, aussitôt remplacée par Scooby et ses amis qui prennent l'enquête.

La bande à Scooby enquête sur le fantôme d'un ancien joueur de baseball, Chip Braverton, qui revient hanter son équipe ce qui risque de mener tout droit son propriétaire à dissoudre le club et vendre le stade.

Toute l'équipe se rend à une exposition sur les mystères et fait la connaissance de Jeff, le guide. Alors que Scooby et ses amis apprennent qu'un monstre crocodile nommé Sobek sévit dans le musée, Jeff propose à Fred de prendre sa place afin de montrer à l'équipe ce que c'est d'avoir un chef compétent.